Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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