Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF4Q5VUM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF4Q5VUM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms