Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEF1A1P5Q5VTE0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms