Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms