Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH4AQ5TD94 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms