Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6L2Q5T890 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6L2Q5T890 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6L2Q5T890 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms