Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00242Q5T6M2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00242Q5T6M2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms