Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf220Q5T0J3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms