Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CC2D1BQ5T0F9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CC2D1BQ5T0F9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CC2D1BQ5T0F9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CC2D1BQ5T0F9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CC2D1BQ5T0F9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CC2D1BQ5T0F9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms