Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLVS2Q5SYC1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLVS2Q5SYC1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms