Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPEREQ5SY80 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPEREQ5SY80 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms