Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYCQ5MJ68 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYCQ5MJ68 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms