Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SAMD9Q5K651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SAMD9Q5K651 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SAMD9Q5K651 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.7 ms