Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXC2

MIIP, Migration and invasion-inhibitory protein, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIIPQ5JXC2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIIPQ5JXC2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIIPQ5JXC2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms