Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms