Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOM1Q5C9Z4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms