Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDK2Q58EX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms