Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD12Q587J7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms