Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDCA8Q53HL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDCA8Q53HL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDCA8Q53HL2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms