Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL22Q53GT1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL22Q53GT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms