Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HSD17B12Q53GQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms