Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SBK1Q52WX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SBK1Q52WX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms