Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms