Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM259Q4ZIN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms