Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1LQ4VXU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1LQ4VXU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms