Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms