Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS9Q3SYG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms