Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SP6Q3SY56 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms