Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTLL9Q3SXZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms