Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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KRTAP13-4Q3LI77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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KRTAP13-4Q3LI77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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KRTAP13-4Q3LI77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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