Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TWISTNBQ3B726 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms