Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms