Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms