Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRED3Q2MJR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRED3Q2MJR0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRED3Q2MJR0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRED3Q2MJR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRED3Q2MJR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRED3Q2MJR0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms