Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A12Q1EHB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A12Q1EHB4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms