Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCK2Q16822 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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