Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF239Q16600 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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