Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDB1Q16531 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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