Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX1Q16384 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX1Q16384 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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