Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN9AQ15858 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN9AQ15858 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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