Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NR6A1Q15406 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR6A1Q15406 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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