Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NKX1-1Q15270 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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NKX1-1Q15270 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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NKX1-1Q15270 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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NKX1-1Q15270 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
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