Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms