Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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