Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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