Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD1Q15011 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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