Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHPRHQ149N8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms