Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSPNQ14714 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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