Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC1AQ14683 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms