Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CKAP5Q14008 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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